В 2013 году Владимир Обухов находился в расположении молодёжной сборной России, где в его пробе были обнаружены следы запрещённого вещества метандиенона — анаболического стероида, который способствует увеличению мышечной массы и укреплению костной системы. Однако его пробу пометили как отрицательную и внесли в базу Московской антидопинговой лаборатории.
«Существуют убедительные доказательства, что были предприняты попытки скрыть неблагоприятный результат анализа (AAF) с помощью «альтернативной методологии исчезновения положительных допинг-проб» (alternative DPM), а также избавиться от следов этого сокрытия».
20-летний Обухов является воспитанником московского «Спартака», выступал также за «Торпедо», «Кубань», «Мордовию», «Тамбов» и сейчас числится в «Ростове», за который провёл два матча.